تقسم عملية التحكيم إلى 6 أو 7 خطوات، المقصود منها توجيه المحكم على الطريق الصحيح لمعاينة طلب النشر.

الخطوة 1
على المحكم إعلام محرر القسم بشأن قبوله لتولي مهمة التحكيم أم لا. هذا القرار ينبغي اتخاذه بعد معاينة الملخص وأحياناً المؤلَّف نفسه عبر النقر على اسم الملف في الخطوة 3 (إعتماداً على سياسات المجلة، قد لا يكون ملف طلب النشر متاحاً للمحكم قبل أن يوافق على تحكيمه).

فيما لو تعذر عليه التحكيم. المحكم الذي يريد الاعتذار عن مهمة التحكيم ينقر على "غير قادر على التحكيم" التي تقوده إلى رسالة قياسية معنونة إلى محرر القسم، يمكن تعديلها حسب الحاجة، يبلغه فيها بتعذر قيامه بتحكيم ذلك المؤلَّف وأسباب ذلك (مثل: التوقيت، تضارب المصالح، نقص الخبرة... إلخ.).

لو كان قادراً وراغباً في التحكيم. المحكم الموافق على إجراء التحكيم ينقر على "سيقوم بالتحكيم،" التي تأخذه إلى رسالة قياسية، يمكن تعديلها حسب الحاجة، معنونة إلى محرر القسم يُعلمه فيها بأنه مستعد لتولي مهمة التحكيم.

الخطوة 2
الرجوع إلى إرشادات المحكم، الموجودة نهاية صفحة التحكيم. تلك الإرشادات سبق إعدادها من قبل مدير التحرير أو هيئة تحرير المجلة لضمان جعل التحكيم مفيداً قدر الإمكان للمجلة لمساعدتها في الحفاظ على مستوى معين من المنشورات التي تقدمها للمجتمع.

الخطوة 3
قام المؤلف برفع ملف طلبه إلى موقع المجلة بحيث يمكن للمحكم تنزيله إلى حاسبته عبر النقر على اسم الملف في الموقع. هذا الملف يمكن معاينته باستعمال برامج معالجة النصوص مثل: Word أو Acrobat. يمكن أيضاً طباعته أو قراءته على الشاشة. الملفات التكميلية تتضمن مواد إضافية قد يكون المؤلف رفعها إضافة إلى الملف الرئيسي مثل: جداول البيانات، معدات البحث، أو ما شابه.

الخطوة 4 (إختيارية)
أحياناً، تطلب المجلة من المحكم الإعلان صراحة فيما لو كانت له مصالح متضاربة مع المؤلَّف الذي وافق على تحكيمه. في تلك الحالة، تكون الخطوة 4 عبارة عن نموذج يطلب الإفصاح عن وجود مصالح متضاربة، ولذلك تتغير أرقام الخطوات اللاحقة تبعاً لوجود هذه الخطوة من عدمه. يمكن لرئيس تحرير المجلة تفعيل هذه الخطوة خلال عملية التهيئة، الخطوة 3.3.

الخطوة 4
ينقر المحكم على إيقونة التحكيم ليحصل على خانتين بشكل مربعي نص يمكن له الكتابة فيهما مباشرة، أو لصق نص معد سلفاً؛ الأول منهما سيراه المحرر والمؤلف، والثاني سيراه المحرر فقط. يمكن للمحكم وضع تقييمات أولية في هاتين الخانتين وحفظها، ومن ثم معاودة تعديلها لاحقاً. يتابع المحكم إدراج تعليقاته وملاحظاته حتى يصل إلى اختيار توصياته بشأن المؤلَّف في صفحة التحكيم الرئيسية، وعندها تكون عملية التحكيم قد اكتملت.

لاحظ لطفاً: قد ينشئ رئيس تحرير المجلة أو طاقم التحرير فيها نموذجاً إضافياً للتحكيم يتضمن تساؤلات معينة على المحكم الإجابة عليها أيضاً. لا بد من التعريف بذلك النموذج في إرشادات التحكيم. يمكن للمحكم مراجعة هذا النموذج مراراً حتى يتوصل إلى التوصية التي يراها مناسبة.

الخطوة 5
للمحكم أيضاً خيار رفع ملفات لمحرر القسم و/أو المحرر لمعاينتها. قد تكون تلك الملفات بمثابة النسخة المعلَّمة من المؤلَّف أو بيانات ذات صلة أو مواد أخرى تساعد المحرر و/أو الملف. سيكون المحرر صاحب القرار فيما لو أراد إطلاع المؤلف على تلك الملفات أم لا، غير أن المحكم سيكون قادراً بالتأكيد على التعليق عن ذلك الأمر خلال (الخطوة 4) أعلاه.

الخطوة 6
على المحكم إختيار التوصية التي يراها مناسبة لطلب النشر من بين الخيارات الآتية: القبول، يتطلب التعديل، إعادة التقديم للتحكيم، إعادة التقديم في مكان آخر، رفض النشر، أنظر الملاحظات. عندما ينقر المحكم على "تقديم التحكيم للمحرر"، سيقوده الموقع إلى رسالة محضرة معنونة إلى محرر القسم، ستُطلعه على نتيجة التحكيم وتوصيته (تلك النتيجة ستكون غير متاحة للتعديل من قبل المحكم). الرسالة نفسها قابلة للتعديل قبل إرسالها إلى المحرر.